在阴离子聚丙烯酰胺絮凝剂中，一般是水解后呈阴性的基团，如--COOH多，水解程度强。很多SS类型物质的表面往往带有电荷，显然，同样带有电荷的絮凝剂就可以利用异性相吸的原理来絮凝SS类型的物质。电荷中和后再利用聚丙烯酰胺本身的分子长连结构把污水中的细小颗粒絮凝成大团物质而形成大的絮团。而形成的较大的絮凝团就会随着重力的增加沉到水体底部，水体上部就较为清澈，这个是污水聚丙烯酰胺絮凝剂的基本絮凝原理。
阴离子和非离子的主要差别就是水解度的区别了 非离子的水解度一般比较低，通常水解度在5以下可以称为非离子 ，而水解度在5以上成为阴离子聚丙烯酰胺 当然这是一种简单的分类方法。你硬要把水解度为6的聚丙烯酰胺分成是非离子的我们也不能说你分错了。阴离子和非离子的界限是不那么明显的。
一般子处理污水的时候。阴离子的分子量一般相对比较高，在处理污水的时候沉降比较快，但是相对于非离子用量比较少 ，但是它没有非离子处理的污水清澈。
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